Primer antecedente y pérdida documental
El primer antecedente del archivo jalisciense se ubica en el Palacio de Gobierno, donde desde 1859 se almacenaba la documentación estatal. Un incendio aquel año destruyó gran parte del acervo, y años después, durante la guerra contra Francia, los documentos fueron trasladados por el Gobierno Constitucional a la campaña, dispersándose con grave peligro de pérdida total.